关键词:
环境监测
诺如病毒
污水
基因型
摘要:
目的了解福建省3个监测点环境污水中诺如病毒(norovirus,NoV)检出情况及型别分布特征,探索其应用于NoV监测的意义。方法每月在代表性监测地区5个采样点采集污水,富集浓缩后,用逆转录半巢式-聚合酶链反应(reverse transcription-semi nested polymerase chain reaction,RT-snPCR)扩增NoV VP1部分基因片段,TA克隆后测序进行基因型别分析。结果2022年7月至2023年6月共收集污水标本56份,GⅠ和GⅡ检出率分别为89.29%(50/56)和94.64%(53/56)。检出GⅠ组7种基因型和GⅡ组13种基因型,其中GⅠ.1、GⅠ.4、GⅡ.4和GⅡ.17为优势基因型。不同采样点检出基因型别不完全一致;2022年8~11月NoV检出率较低,且不同季节流行优势基因型不同,GⅠ.1和GⅡ.4在2022年8~11月呈高流行,但2022年12月到2023年6月分别被GⅠ.4和GⅡ.17取代。2023年1~6月相较2022年7~12月检出型别丰度更高。优势基因型GII.17具有多进化分支,发现了不同于2014/2015年流行株的新变异株。结论环境污水NoV检出率高且基因型别多样,具备发现新变异病毒株的能力,环境污水监测可做为NoV病例监测的重要补充手段。