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关键词： 牛病毒性腹泻病毒   重组酶介导等温核酸扩增技术   CRISPR/Cas12a   检测  

摘要： 为建立一种基于重组酶介导的扩增技术(RAA)和CRISPR/Cas12a相结合的牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus，BVDV)可视化检测方法。参考GenBank数据库中BVDV 5’UTR基因设计RAA反应的特异性引物和探针，进一步优化RAA-CRISPR/Cas12a反应条件，通过测定灵敏度、特异性和重复性来评估RAA-CRISPR/Cas12a检测方法。分别使用PCR和RAA-CRISPR/Cas12a对251份犊牛腹泻样品进行了BVDV阳性检测。结果表明，RAA-CRISPR/Cas12a检测方法检测BVDV的最低检测限为3 copies/μL，检测时间为30 min。在对比不同拷贝数阳性样品进行多批次检验后，批内和批间变异系数皆小于5%。用该方法在检测其他牛常见病原微生物时结果均呈阴性，特异性良好。在临床样本检测中，BVDV的PCR阳性检出率为6.37%；同时使用RAA-CRISPR/Cas12a检测时，阳性检出率为29.48%，阳性检出率达到4.63倍。本研究建立了基于RAA-CRISPR/Cas12a的BVDV可视化快速检测方法，对犊牛腹泻的防控具有重要意义。

关键词： 水开菲尔   宏基因组   代谢组   菌群   相关性分析  

摘要： 水开菲尔是一种备受欢迎的非乳制品发酵饮料，其质量特性与发酵过程中微生物群落结构及代谢产物紧密相关，因此揭示水开菲尔微生物-代谢物的时间特征具有重要意义。该研究以不同发酵时间的水开菲尔为研究对象，通过宏基因组测序从菌种层面解析水开菲尔发酵液中的群落变化，基于非靶向代谢组学技术测定水开菲尔的代谢物成分并进行关联分析。结果显示，Liquorilactobacillus vini、Schleiferilactobacillus harbinensis是水开菲尔发酵过程中的优势菌种。水开菲尔标志性代谢产物在发酵前期为糖类及其衍生物，而在发酵后期主要为氨基酸、有机酸及其衍生物。此外，相关性分析揭示了水开菲尔微生物-代谢物网络中以Lacticaseibacillus paracasei为代表的低丰度菌种与多个标志性代谢物之间呈显著正相关，以Saccharomyces cerevisiae为代表的低丰度菌种呈显著负相关。结果表明，水开菲尔发酵过程中低丰度微生物在水开菲尔微生物-代谢网络中占据核心地位，该研究可为优化水开菲尔发酵工艺及提升产品质量提供理论支持。

关键词： 极小种群   广西青梅   林下植物   SPAD值   微生境特征  

摘要： 珍稀濒危植物由于分布范围狭窄、种群更新困难等因素，生存和繁衍面临危机，亟需保护。对群落林下植物和微生境进行调查是保护珍稀濒危植物的工作内容之一。广西青梅是极小种群植物，亦是国家I级重点保护野生植物，为研究广西青梅群落林下植物的相对叶绿素含量及微生境特征，评估广西青梅在群落中的光资源利用情况，对那坡县百合乡广西青梅保护小区进行了调查，测定了林下植物SPAD（Soil and Plant Analyzer Development）值和温度、光照等微生境因子。结果显示，微生境是影响广西青梅生长发育的重要因素。广西青梅群落林下微生境较为复杂，存在明显坡面且郁闭度高，林下植物组成和光合利用策略有明显区别。此外，相较于群落内其他植物，广西青梅的SPAD值处于较低水平，说明其光合水平较低。后期可结合适当开林窗、合理清除冗杂植物枝叶等手段，进一步提高广西青梅光合效率。

关键词： 群落结构   综合水质标识指数   熵权法   综合水质生物学指数  

摘要： 随着国家环境保护的战略转移，综合水质理化评价和水质生物学评价全面阐明水域生态环境的质量状况，对水资源管理和水环境保护具有重要意义。于2020年8月—2021年7月期间对江苏省扬州市的宝应湖进行了逐月水体理化性质调查和4个季度的大型底栖动物调查，分析大型底栖动物群落结构与环境因子的关系，并采用综合营养状态指数、综合水质标识指数和基于熵权法的综合水质生物学指数综合评价宝应湖的水生态健康状况。共采集大型底栖动物15种，优势种为中国长足摇蚊（Tanypus chinensis）、红裸须摇蚊（Propsilocerus akamusi）、霍甫水丝蚓（Limnodrilus hoffmeisteri）、梨形石田螺（Sinotaia purificata）和铜锈石田螺（Sinotaia aeruginosa），摇蚊幼虫和腹足纲分别主导了宝应湖大型底栖动物密度和生物量的时空分布。宝应湖水体理化性质在空间上除水深外无明显差异，但四季之间差异显著。冬季透明度（SD）显著高于其他季节；夏季高锰酸盐指数(CODMn)和总氮（TN）显著高于其他季节。SD、CODMn和TN是影响宝应湖大型底栖动物群落的主要环境因子。宝应湖全年营养水平处于中营养-中度富营养水平，综合水质标识指数显示宝应湖属于Ⅲ-Ⅳ类水，综合水质生物学指数显示宝应湖水质整体处于一般到极差状态。水质生物学评价结果差于水质理化评价，表明水质并不是限制宝应湖水生态健康的唯一因素。

关键词： 杆状病毒   核定位信号   核转运受体   核孔复合物   蛋白修饰  

摘要： 杆状病毒是一类具有双链、环状、超螺旋DNA结构的病毒，其转录、复制以及子代病毒的组装都发生在细胞核内，而由于细胞核膜这一天然屏障的存在，分子量大于40～60 kDa的大分子物质无法直接穿透核膜，因此，病毒进化出了不同的策略来实现病毒蛋白的跨核膜转运。本文综述了杆状病毒编码蛋白的核转运途径，主要有杆状病毒衍生出的依赖核定位信号（nuclear localization signal, NLS）的经典核转运途径和不依赖NLS的非经典核转运途径。此外，病毒还会通过蛋白修饰、改变宿主结构等方法调控入核途径，从而实现病毒蛋白的核转运。

关键词： 耐受值   大型底栖无脊椎动物   辽河流域   综合压力梯度  

摘要： 耐受值可以定量比较生物在已知环境压力下的相对生存和繁殖能力大小。由于其可以描述生物在环境压力下协同进化出来的相对丰富度的多少和共存位置关系，因此常被用于构建水生生物评价指标。早期耐受值计算仅考虑了水环境质量或以生物多样性划分环境压力等级，难以全面反映水生态系统综合环境压力。本研究使用主成分分析法，将物理栖息地、水质和土地利用等变量结合形成综合可量化的环境压力梯度。基于各分类单元随该压力梯度的响应方式，使用权重平均值法计算了辽河流域大型底栖无脊椎动物各级分类单元的环境压力耐受值。计算数据来自辽河流域436个监测样点，最终对108个最低分类单元（属级或种级）、64个科级分类单元、23个目级分类单元和10个纲级分类单元，共计205个分类单元的耐受值进行了计算。通过建立生物指数和压力梯度之间的线性回归模型来判断耐受值的准确性。结果显示，生物评价指标同环境压力梯度之间有极好的响应关系，同时评价指标的判别能力也要显著高于以往研究结果，表明本研究计算的环境压力耐受值准确性更高，可以在辽河流域或者北方相似河流的生物评价中推广使用。

关键词： 卷积神经网络   注意力机制   精准农业   蜜源识别分类   数据集融合  

摘要： 目的:针对蜜源植物种类繁多及其复杂的外观特征，提出一种高效且准确的识别和分类方法，旨在提升蜜蜂授粉活动的生态效益以及蜂蜜生产的质量和效率。方法:提出一种使用改进版轻量化模型MobileNet V3进行蜜源植物识别和分类的方法。通过数据融合的方式扩展数据集，结合ECA机制优化通道间的特征权重分配，同时引入Mish激活函数以改善模型的非线性特性，提升蜜源植物的识别准确性。结果:改进后的模型识别准确率由原模型的89.59%提升至94.20%，精确度从89.9%提升至94.5%，改进后的模型体积由原来的16 MB优化至10 MB，展现了更为出色的性能与效率。结论:提出的改进方法显著提高了蜜源植物识别的准确性和效率并减少了存储和计算资源的占用，对精准农业和蜂蜜生产具有重要的实际应用价值。