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关键词： 人呼吸道合胞病毒   B亚型   全基因组   分子特征  

摘要： 目的 分析1株青海省人呼吸道合胞病毒(HRSV)全基因组的基因特征。 方法 收集2024年青海省流感监测哨点医院的发热并伴有严重呼吸道感染症状的标本共300份，通过实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法筛选出HRSVB阳性标本，对符合测序要求的阳性标本进行全基因组测序。在GenBank数据库下载HRSVB全球各基因型别代表株后进行序列比对、亲缘关系进化树构建和遗传距离的计算分析，分析HRSVB测序株序列核苷酸、氨基酸的同源性和氨基酸变异。 结果 青海首株China/qinghai/2024-03的全基因组序列为15 140bp，具有HRSV的所有结构特征，与HRSVA亚型原型株Long株的核苷酸同源性最低为80.0%，与HRSVB亚型原型株核苷酸同源性94.7%，说明青海首株为HRSVB亚型；遗传进化显示China/qinghai/2024-03与USA/WA-S23450/2021(OR326803.1)及Germany/2021(OR795235.1)同属一个分支，提示亲缘关系最近，G基因遗传进化分析表明该毒株属于HRSVB亚型BA9基因型，相似性分析表明基因组的高变区域为SH和G基因。 结论 本研究首次获得HRSV China/qinghai/2024-03全基因组序列，并阐明了其基本的分子结构特征，填补了青海省HRSV病毒的基因及氨基酸数据空缺，也为HRSV流行病学提供了依据。

关键词： 手足口病   柯萨奇病毒A16   分子流行病学   B1c遗传进化分支  

摘要： 目的 了解2020—2023年间柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16, CVA16)在福建省的分子流行病学特征。 方法 对2020—2023年福建省CVA16相关手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)进行流行病学特征分析；RT-PCR扩增CVA16完整VP1基因并进行序列测定，采用MEGA X等软件进行CVA16的遗传进化分析。 结果 福建省2020—2023年合计13 120份HFMD病例，CVA16相关HFMD构成比为16.5%(2 160/13 120)，其中，2020—2023年各年度分别占4.7%(94/2 019)、14.1%(457/3 243)、47.6%(1 521/3 199)、1.9%(88/4 659)。CVA16引起HFMD患者主要集中在1~5岁儿童，3岁居多。获取的福建省2020—2023年92条完整CVA16 VP1基因序列遗传进化和基因型特征分析显示，福建省CVA16毒株与原型株遗传距离较远；2020—2023年福建省CVA16基因型存在B1a、B1b、B1c三种基因进化分支，其中，福建省2020年B1a与B1b构成比各占40%和60%；2021年B1a与B1b各占81.8%和18.2%；2022年仅有B1a；2023年有B1a、B1b与B1c，分别占44.4%、7.4%、48.2%，1~9月以B1a为主要流行株，10月后福建省既往未曾发现且在国内罕见的B1c被检出，并成为优势基因分支。 结论 福建省CVA16优势基因进化分支从2020年的B1b逐渐转变为2021—2023年的B1a。2023年10月后，福建省新发现的B1c成为本省优势基因进化分支。

摘要： 2024年10月9日，《Cell》杂志发表了题为"Using Artificial Intelligence to Document the Hidden RNA Virosphere"文章。中山大学侯新博士、阿里云贺勇为文章共同第一作者。中山大学施莽教授、阿里云李兆融和悉尼大学Edward Holmes教授为文章共同通讯作者。

关键词： 鼻病毒   新型冠状病毒   临床特征   加重儿童  

摘要： 目的 本研究旨在阐明新型冠状病毒疫情背景下鼻病毒感染患儿的临床特征，探讨新冠病毒近期感染史对其临床特征的影响。 方法 收集2022年7月至2023年10月在杭州市儿童医院住院的经实验室确诊为鼻病毒检测阳性的286例患儿的临床资料、实验室检查结果；并回顾性调查所有研究对象在本次住院前6个月内是否曾有新冠病毒感染病史。 结果 286例鼻病毒检测阳性患儿中，单纯鼻病毒阳性者180例(62.94%)，合并其他病原体感染者106例(37.06%)；180例单纯鼻病毒阳性患儿中，56.67%患儿出现喘息症状。其中15例(15/180，8.33%)患儿表现为哮喘急性发作；7例(7/180，3.88%)表现为重症肺炎。根据患儿在本次住院前6个月内有无新冠病毒感染病史，分为既往有新冠病毒感染组、既往无新冠病毒感染组。两组间在性别、发病年龄、发热高峰、喘息发生率、肺炎发生率、重症肺炎占比率、重度哮喘发作的占比率、发热持续时间、喘息缓解时间、住院时间、白细胞计数、嗜酸粒细胞计数、C反应蛋白、降钙素原、免疫球蛋白E、氧疗需求、静脉激素使用情况等方面均无显著性差异( P >0.05)。 结论 喘息发生率、肺炎发生率、重症肺炎占比率、重度哮喘发作的占比率近6个月内有新冠病毒感染病史并不会导致鼻病毒感染患儿的临床症状加重，亦不会增加其喘息发生率。

关键词： 轮状病毒感染   腹泻   免疫   儿童,学龄   神曲消食口服液   喜炎平  

摘要： 目的 探讨神曲消食口服液联合喜炎平治疗小儿轮状病毒感染性腹泻的疗效及对免疫功能的影响。方法将200例轮状病毒感染性腹泻患儿随机均分为2组，对照组患儿予以喜炎平治疗，实验组患儿予以神曲消食口服液联合喜炎平治疗，比较2组治疗效果及对患儿炎性因子及免疫功能的影响。结果 实验组临床总有效率高于对照组（P<0.05）；治疗后，实验组患儿中医证候积分、血清白细胞介素（IL）-6、肿瘤坏死因子（TNF）-α、干扰素（INF）-γ、超敏C-反应蛋白（hs-CRP）水平及CD8+水平均低于对照组（P<0.05），血清CD3+、CD4+及CD4+/CD8+水平均高于对照组（P<0.05）。实验组患儿止泻时间早于对照组，轮状病毒转阴率高于对照组（P<0.05）。结论 神曲消食口服液联合喜炎平治疗小儿轮状病毒感染性腹泻能快速缓解患儿症状，减轻炎症反应，提高免疫功能。

关键词： 戊型肝炎病毒   猪肝   病毒回收   核酸检测   基因分型  

摘要： 目的 对猪肝中戊型肝炎病毒(hepatitis E virus，HEV)核酸检测方法进行优化和比较，为动物内脏标本中HEV检测提供技术参考。 方法 分别采用三种方法(PBS匀浆处理法、蛋白酶K处理法、氯仿抽提法)对人工污染HEV粪便悬液的猪肝标本进行前处理和病毒核酸提取，通过HEV RT-qPCR检测，比较HEV回收率、抑制率。将筛选出的最优的HEV检测方法应用于市售猪肝检测，对检出的阳性标本进行HEV基因分型。 结果 PBS匀浆处理法、蛋白酶K处理法、氯仿抽提法的HEV回收率分别为9.88%、0.19%和17.28%。蛋白酶K处理法的回收率小于1%，舍弃该方法，对其他两种方法进行 t 检验，结果表明两种方法回收率的差异具有统计学意义( t ＝26.801， P <0.001)，氯仿抽提法的回收率较高。三种方法的抑制率均小于75%，在ISO/TS 15216-2∶2019标准的范围内。在192份市售猪肝标本中检出17份HEV RNA阳性标本，核酸阳性率为8.85%，其中5份标本HEV基因分型成功，均为基因4型。 结论 用氯仿抽提法对猪肝进行前处理，病毒回收效果较好，且在市售猪肝标本中检出HEV核酸阳性标本，该方法可用于食品中病毒的检测。

关键词： 感受态细胞   大肠杆菌   马胚胎成纤维细胞   慢病毒   基因表达  

摘要： 外源质粒转化宿主细胞已成为基因工程和DNA克隆技术基础与核心，是现代分子生物学的重要技术之一。使用大肠杆菌感受态细胞进行转化试验完成外源基因的表达是实验室常用的手段。但由于大肠杆菌感受态细胞种类繁多，选择基因表达效果理想的感受态细胞是必要的。因此为获得用于马胚胎成纤维细胞感染慢病毒包装体系的转化感受态，本研究分别用了三种不同的感受态细胞（DH5α、Stbl3和INV110）来转化FUW-tetO-EGFP质粒后，使用293T细胞包装病毒颗粒，之后用收集的病毒颗粒感染293T细胞和马胚胎成纤维细胞，通过观察荧光信号，比较三者的转染及感染效率。结果显示，对于转染效率的比较，我们发现使用DH5α感受态细胞转化之后的质粒其转染293T细胞的效率显著高于INV110感受态和Stbl3感受态组；而对于感染效率的比较，使用Stbl3感受态转化之后的质粒其包装的病毒感染293T细胞和马胚胎成纤维细胞的效率都显著高于DH5α感受态细胞和INV110感受态组。上述结论表明了Stbl3感受态细胞可用于马胚胎成纤维细胞感染慢病毒质粒转化的感受态细胞，这些结果将为建立完整的慢病毒包装体系奠定基础，为后续马的基因功能研究工作提供基础试验数据。

关键词： 肿瘤相关巨噬细胞   肿瘤微环境   免疫治疗   细胞治疗   癌症  

摘要： 抗肿瘤免疫治疗在过去几十年里取得了显著的突破，在某些类型的癌症中展现了前所未有的疗效，但耐药性的出现不仅限制了免疫治疗的长期有效性，还可能导致癌症复发和进展。因此，如何克服免疫治疗耐药，已成为当前癌症研究中亟待解决的关键问题。肿瘤相关巨噬细胞（TAM）近年来已逐渐成为癌症治疗中的一种重要方案和选择，作为潜在的治疗靶点，它们在肿瘤微环境（TME）中的独特作用使其在抗肿瘤治疗中展现出前景。对于癌症治疗中的TAM研究，当前的探索包括多个方面的内容和挑战。这些研究不仅涉及TAM在不同肿瘤类型中的作用机制，还涵盖了TAM在TME中与其他免疫细胞、信号通路的相互作用。因此，本文就TAM在抗肿瘤免疫治疗中的应用进行综述，旨在为未来相关研究提供参考。

关键词： 甲状腺癌   EB病毒   微小核糖核酸-222-3p   Janus激酶   信号转导与转录激活因子  

摘要： 目的 分析EB病毒感染对甲状腺癌患者外周血微小核糖核酸(miR)-222-3p和Janus激酶/信号转导与转录激活因子(JAK/STAT)信号通路表达的影响。方法 选择2021年1月—2024年1月在内蒙古医科大学附属医院住院且确诊感染EB病毒的100例甲状腺癌患者为感染组,另选取同期未感染EB病毒的60例甲状腺癌患者为非感染组,检测患者外周血miR-222-3p、JAK/STAT信号通路表达水平,绘制受试者工作特征(ROC)曲线评估外周血miR-222-3p、JAK/STAT信号通路对甲状腺癌患者并发EB病毒感染的诊断价值。结果 感染组外周血miR-222-3p、p-JAK1/JAK1、p-JAK2/JAK2、p-STAT1/STAT1表达水平分别为(0.28±0.10)、(2.13±0.38)、(1.94±0.21)、(2.81±0.34)均高于非感染组(P<0.05);不同EB病毒DNA(EBV-DNA)载量患者miR-222-3p、JAK/STAT信号通路水平比较差异有统计学意义(P<0.05),且高载量组患者水平更高(P<0.05);ROC曲线分析显示,外周血miR-222-3p联合JAK/STAT信号通路诊断甲状腺癌患者并发EB病毒感染的曲线下面积(AUC)最大,为0.892。结论 EB病毒感染上调外周血miR-222-3p表达,激活JAK/STAT信号通路,可能参与甲状腺癌的发生与发展,外周血miR-222-3p、JAK/STAT信号通路有望成为判断甲状腺癌EB病毒感染的生物学指标。

关键词： 乙型流感病毒   血凝素   神经氨酸酶   遗传进化分析  

摘要： 目的 了解西安市2019—2023年分离的乙型Victoria系流感病毒(BV)血凝素(hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)的基因特性和遗传进化特征。 方法 收集西安市流感监测网络实验室2019—2023年分离的BV毒株25株，利用MiniSeq高通量测序平台对HA和NA基因进行测序；利用生物信息学软件构建进化树，分析同源性及变异位点，在线预测N-糖基化位点；通过血凝抑制试验分析毒株的抗原性。 结果 西安市2019—2023年BV型流感呈季节性传播，流行高峰集中在冬春季。HA基因进化分析结果显示，西安市2019年毒株属于V1A.3分支，2021—2023年毒株属于V1A.3a.2分支。抗原位点分析显示，2021—2022年BV毒株HA蛋白与2019年相比有3个抗原决定簇的6个位点发生变异，2023年HA蛋白与2021—2022年相比变化了1个抗原决定簇的2个位点。2019年西安市BV毒株NA基因进化上属于A.1.1分支，到2021和2022年进化为A.1.2分支，2023年又进化为B分支及其衍生株，所有毒株均未发生NA抑制剂相关耐药位点变异。抗原分析结果显示西安市BV毒株多为疫苗组分株的类似株。糖基化分析结果显示2021—2023年毒株HA蛋白潜在糖基化位点比2019年毒株少1个，而NA蛋白的潜在糖基化位点仅有2023年个别毒株发生改变。 结论 2019—2023年西安市BV毒株HA和NA基因在不断发生变异，进化成新的分支。自2021年起V1A.3a.2成为HA基因优势进化分支，而2019—2023年NA基因进化分支不断改变。