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关键词： 水开菲尔   宏基因组   代谢组   菌群   相关性分析  

摘要： 水开菲尔是一种备受欢迎的非乳制品发酵饮料，其质量特性与发酵过程中微生物群落结构及代谢产物紧密相关，因此揭示水开菲尔微生物-代谢物的时间特征具有重要意义。该研究以不同发酵时间的水开菲尔为研究对象，通过宏基因组测序从菌种层面解析水开菲尔发酵液中的群落变化，基于非靶向代谢组学技术测定水开菲尔的代谢物成分并进行关联分析。结果显示，Liquorilactobacillus vini、Schleiferilactobacillus harbinensis是水开菲尔发酵过程中的优势菌种。水开菲尔标志性代谢产物在发酵前期为糖类及其衍生物，而在发酵后期主要为氨基酸、有机酸及其衍生物。此外，相关性分析揭示了水开菲尔微生物-代谢物网络中以Lacticaseibacillus paracasei为代表的低丰度菌种与多个标志性代谢物之间呈显著正相关，以Saccharomyces cerevisiae为代表的低丰度菌种呈显著负相关。结果表明，水开菲尔发酵过程中低丰度微生物在水开菲尔微生物-代谢网络中占据核心地位，该研究可为优化水开菲尔发酵工艺及提升产品质量提供理论支持。

关键词： 猪圆环病毒2型   病毒样颗粒   三倍轴区域   外源表位  

摘要： 为了探索PCV2病毒样颗粒三倍轴区域展示外源抗原表位的潜力，本研究借助结构模拟和蛋白质的三维结构展示，分析了PCV2核衣壳表面氨基酸残基突变后的结构差异。通过分析不同cap基因突变质粒在大肠杆菌表达系统中所表达的突变体蛋白的可溶性和纯化难易程度，确定合适的外源表位嵌合区。将嵌合PPV抗原表位的Cap蛋白经体外组装获得重组的病毒样颗粒，将此病毒样颗粒免疫小鼠，通过抗体检测来评价其免疫原性。结果显示，PCV2核衣壳表面三倍轴区域存在两个适合用于展示外源表位的氨基酸区域（命名为Motif A和Motif B）；相同表达条件下，Motif A区域的突变蛋白均以可溶性表达为主，且能一步纯化获得目的蛋白，而Motif B区域的突变蛋白多以包涵体形式存在；Motif A区域嵌合PPV表位后，纯化的重组蛋白能在体外组装成cVLPs，并通过间接免疫荧光实验证明其保留有野生型VLPs内化PK15细胞的能力；形成的cVLPs能刺激小鼠机体产生分别针对PCV2 VLPs、B5-E1表位和PPV VP2蛋白的抗体。结果表明PCV2 Cap蛋白Loop GH区域Motif A能够将外源表位展示在病毒样颗粒外表面，并且能够被机体免疫细胞识别产生特异性抗体。

关键词： 盾额隆背溞   种群结构   繁殖力   种群动态   稀有物种  

摘要： 稀有种具有典型的狭域分布和生境利用专化等特点，可能携带着物种致危机制的重要信息，厘清其稀有成因将有力促进生态学理论的进一步发展。盾额隆背溞是一种罕见枝角类，国内仅记述过4个样品。除少量分类学形态描述外，其关键性生物学及生态学特征迄今尚未被揭示。本文在滇池流域枝角类系统调查中首次采集得到盾额隆背溞活体，通过扩繁取得丰富研究材料，并围绕其种群结构、种群繁殖力、种群动态参数等关键种群生态学特征开展研究，以初步了解其种群稀有成因。2022—2023两年的研究结果显示，盾额隆背溞为微小型枝角类（体长0.30～1.15 mm），初次性成熟体长约为0.52 mm。未在种群中检出雄性个体。2022年室外种群夏卵繁殖力为（2.2±1.4） eggs·ind-1(n=334， 最大值为8 eggs·ind-1)，2023年为（4.8±2.8） eggs·ind-1(n=94， 最大值为13 eggs·ind-1)。产冬卵时，卵鞍含卵2个。在生命表试验中，以小球藻培养的种群子一代(F1)、子二代(F2)最大繁殖龄期数分别为8和7个，总生殖率分别为30.3和9.4 eggs·ind-1，最长个体寿命分别为21和16 d，种群内禀增长率分别为0.37和0.36；以泥糜培养液培养的种群F1、F2最大繁殖龄期数均为8个，其总生殖率分别为40.3和36.1 eggs·ind-1，最长个体寿命分别为28 和27 d，内禀增长率分别为0.31和0.30。在合适环境下盾额隆背溞种群增长迅速，其瞬时增长率为0.39·d-1，在第10天种群数量已达起始的50倍，相对密度达510 ind·L-1，并进入平台期。在自然环境中其种群丰度极低，2022年在水体干枯期种群消失；在2023年的连续观察中，其种群在丰水期突然从观察区域完全消失。分析表明，盾额隆背溞具有相对较长寿命、较高繁殖力及较强的种群增长潜力，与众多常见种相比没有呈现明显的劣势，其在自然界中种群稀少可能并不是由其个体生物学及种群生态学基本特征受限所致，而是对环境选择压力应对具脆弱性所致。

关键词： 禽腺病毒4型   长链非编码RNA   蛋白互作   细胞凋亡   先天性免疫   致病机理  

摘要： 由禽腺病毒4型（FAdV-4）引起的心包积液性肝炎综合征近年来在我国频频发生，给我国家禽养殖业造成了巨大损失。lncRNA是病毒感染期间宿主免疫反应的关键调节因子，为揭示其在FAdV-4感染时对其宿主细胞的作用及机理，本研究以鸡肝癌细胞系LMH为研究对象，通过芯片测序、生物信息学分析及Real-time PCR等方法筛选病毒感染过程中的关键lncRNA分子，并通过荧光定位杂交、CNC分析、Real-time PCR、酶联免疫吸附（ELISA）、RNA pull-down和蛋白免疫共沉淀（RIP）、流式细胞分析等分子生物学手段对其进行亚细胞定位分析及互作蛋白的筛选、验证和功能分析。结果表明，筛选出了FAdV-4感染引起的关键lncRNA分子lnc87774，其主要定位在细胞质，其靶向结合互作蛋白为E3泛素连接酶MDM2，过表达 lnc87774，MDM2和Bcl-2的相对表达量显著上升，p53和Bax的相对表达量显著下降，显著抑制细胞凋亡；沉默lnc87774，上述基因表现出相反的变化趋势且显著促进细胞凋亡；进一步沉默MDM2后，p53的表达量显著上调，但同时过表达/沉默lnc87774对FAdV-4引起的细胞凋亡没有影响，表明FAdV-4感染LMH细胞过程中lnc87774通过MDM2靶向调控p53介导的细胞凋亡进程。该研究结果将增加我们对FAdV-4与宿主细胞互作的认识，为宿主抗病毒防御机制提供理论支持。

关键词： 美洲狼尾草   GATA转录因子   生物信息学分析   非生物胁迫  

摘要： GATA转录因子在植物生长发育和抗逆等过程中起着重要作用。本研究从美洲狼尾草（Pennisetum glaucum L.）基因组数据中共鉴定出29个GATA基因家族成员，染色体定位分析显示29个PgGATA基因不均匀地分布在7条染色体上。根据序列特征和结构域特点将其分为4个亚族，不同亚族成员之间呈现出明显的差异，而在家族内部成员之间的差异则相对较小。保守基序预测表明GATA结构域在各个亚家族中规律分布。顺式作用元件预测结果显示，美洲狼尾草GATA基因上游调控序列中存在大量与植物生长发育和逆境胁迫相关的顺式元件。PgGATA基因家族的表达分析发现多数PgGATAs成员在分蘖组织、叶片以及茎秆中的表达量较高，部分PgGATAs基因家族成员在高温、干旱以及盐胁迫处理中明显表达。本研究为进一步研究美洲狼尾草GATA转录因子的功能及调控机制提供了理论依据和指导。

关键词： 极小种群   广西青梅   林下植物   SPAD值   微生境特征  

摘要： 珍稀濒危植物由于分布范围狭窄、种群更新困难等因素，生存和繁衍面临危机，亟需保护。对群落林下植物和微生境进行调查是保护珍稀濒危植物的工作内容之一。广西青梅是极小种群植物，亦是国家I级重点保护野生植物，为研究广西青梅群落林下植物的相对叶绿素含量及微生境特征，评估广西青梅在群落中的光资源利用情况，对那坡县百合乡广西青梅保护小区进行了调查，测定了林下植物SPAD（Soil and Plant Analyzer Development）值和温度、光照等微生境因子。结果显示，微生境是影响广西青梅生长发育的重要因素。广西青梅群落林下微生境较为复杂，存在明显坡面且郁闭度高，林下植物组成和光合利用策略有明显区别。此外，相较于群落内其他植物，广西青梅的SPAD值处于较低水平，说明其光合水平较低。后期可结合适当开林窗、合理清除冗杂植物枝叶等手段，进一步提高广西青梅光合效率。

关键词： 牛结节性皮肤病病毒   EGFP   抗病毒药物   高内涵筛选  

摘要： 为实现抗牛结节性皮肤病病毒（LSDV）药物的高内涵筛选（HCS），选取LSDV复制非必需基因TK作为增强绿色荧光蛋白（EGFP）的插入区域，构建了表达EGFP的重组LSDV，该重组病毒rLSDV-ΔTK-EGFP与野生型LSDV的生长特性无明显差异。基于rLSDV-ΔTK-EGFP，建立了抗LSDV药物的高内涵快速筛选方法，使用该方法对天然产物库中的1 036个化合物进行了筛选。结果显示，该方法筛选到5个具有抗LSDV活性的化合物。进一步检测LSDV117蛋白表达水平和LSDV043基因拷贝数，结果表明，在MDBK细胞上经过5种化合物处理后可以显著抑制LSDV，且化合物浓度为10 μmol/L时，均无明显细胞毒性。上述结果表明，构建的表达EGFP的重组LSDV可以用于抗LSDV药物的高内涵筛选，具有较高的筛选效率，对于提高动物个体抗病毒能力，缓解牛结节性皮肤病症状，减少经济损失等方面具有重要意义。

关键词： 群落结构   综合水质标识指数   熵权法   综合水质生物学指数  

摘要： 随着国家环境保护的战略转移，综合水质理化评价和水质生物学评价全面阐明水域生态环境的质量状况，对水资源管理和水环境保护具有重要意义。于2020年8月—2021年7月期间对江苏省扬州市的宝应湖进行了逐月水体理化性质调查和4个季度的大型底栖动物调查，分析大型底栖动物群落结构与环境因子的关系，并采用综合营养状态指数、综合水质标识指数和基于熵权法的综合水质生物学指数综合评价宝应湖的水生态健康状况。共采集大型底栖动物15种，优势种为中国长足摇蚊（Tanypus chinensis）、红裸须摇蚊（Propsilocerus akamusi）、霍甫水丝蚓（Limnodrilus hoffmeisteri）、梨形石田螺（Sinotaia purificata）和铜锈石田螺（Sinotaia aeruginosa），摇蚊幼虫和腹足纲分别主导了宝应湖大型底栖动物密度和生物量的时空分布。宝应湖水体理化性质在空间上除水深外无明显差异，但四季之间差异显著。冬季透明度（SD）显著高于其他季节；夏季高锰酸盐指数(CODMn)和总氮（TN）显著高于其他季节。SD、CODMn和TN是影响宝应湖大型底栖动物群落的主要环境因子。宝应湖全年营养水平处于中营养-中度富营养水平，综合水质标识指数显示宝应湖属于Ⅲ-Ⅳ类水，综合水质生物学指数显示宝应湖水质整体处于一般到极差状态。水质生物学评价结果差于水质理化评价，表明水质并不是限制宝应湖水生态健康的唯一因素。

关键词： 水氮盐耦合   生长   光合作用   盐化土壤   芦竹  

摘要： 为探究水氮盐耦合对能源植物芦竹生长发育和光合作用的影响，明确不同盐化程度土壤上适宜芦竹生长的水氮条件，基于盆栽试验，设置土壤盐分（S0：非盐化土、S1：轻度盐化土、S2：中度盐化土和S3：重度盐化土）、施纯氮量(N0：0、N1：60、N2：120和N3：180 kg/hm2)、灌溉定额(W0：2 850、W1：4275、W2：5 700和W3：7 125 m3/hm2)三因素四水平正交试验。结果表明，水、氮、盐单因素对芦竹株高、茎粗、叶宽、单丛鲜重和干重均有显著影响（P<0.05），水盐及水氮耦合对芦竹株高、茎粗、叶宽、单丛鲜重和干重有显著影响（P<0.05）；水、盐单因素对芦竹净光合速率、蒸腾速率和气孔导度有显著影响（P<0.05）。施氮量和灌水量一定时，与对照相比，轻度盐化土壤上芦竹的株高、茎粗、叶长、叶宽、单丛鲜干重、净光合速率、蒸腾速率、气孔导度等特征未产生显著差异（P>0.05）；中度和重度盐化土壤上以上特征产生显著差异（P<0.05）；随着施氮量或灌水量的增加，芦竹株高、茎粗、叶长、叶宽、单丛鲜干重、净光合速率、蒸腾速率、气孔导度均呈现出先上升后下降的趋势。非盐化土上中氮中水处理下芦竹的单丛鲜重和干重达到各处理下最大，非盐化土壤耦合中氮中水处理的芦竹单丛鲜重和干重达到各处理中最大，分别为148.45 g和45.90 g；轻度盐化土上，中氮低水处理下的芦竹可以同时有着较高的生物量积累和水氮利用效率；中度盐化土上，中氮中水处理下的芦竹可以在水氮利用效率较高的同时达到最优产量；重度盐化土上，芦竹生长发育明显受限，水氮利用效率也处于较低水平，需要采取更加综合的土壤改良措施以促进芦竹的生长发育。综上所述，水氮调控能提升芦竹在高盐土壤上的生物量积累。

关键词： 宝天曼站   气象监测   亚热带暖温带过渡区   森林生态系统  

摘要： 气象数据是评估全球气候变化的重要基础性资料，是研究生态系统水碳循环、物候变化、生物多样性以及生态系统演变的重要依据。宝天曼森林生态系统国家野外科学观测研究站（简称“宝天曼站”）位于我国北亚热带向暖温带的过渡地带，地理位置独特。宝天曼站始建于1993年，2005年获原国家林业局正式批准，并于2021年入选了国家野外科学观测研究站，是中国森林生态系统研究网络（CFERN）和国家野外科学观测定位研究站之一。本研究依据《大气环境要素观测数据整理方法》，对气象数据进行整编。本数据集包含了2017–2022年宝天曼站基本大气要素日尺度数据，包括温度、相对湿度、气压、风速、风向、降水量、土壤温度（10、20、30、40、50 cm土壤日均温度）、土壤湿度（10、20、30、40、50cm土壤日均湿度）等指标，为全球变化的背景下森林生态系统的各项研究提供基础资料。