关键词:
结直肠癌
下一代测序技术
微卫星不稳定
微卫星稳定
DNA错配修复
肿瘤突变负荷
EB病毒
拷贝数变异
体系突变
胚系突变
摘要:
目的对四川地区结直肠癌患者进行基因测序,以分析其微卫星不稳定(MSI)的分子特征。方法采用第二代测序技术(NGS)方法对2017年至2022年四川省成都市第三人民医院14239例结直肠癌患者的进行检测,包含单核苷酸位点变异(SNV)、插入和缺失(InDel)、拷贝数变异(CNV)、基因融合(fusion)、MSI、肿瘤突变负荷(TMB)、EB病毒(EBV)等。比较高度微卫星不稳定(MSI-H)患者(MSI-H组,n=1018)和微卫星稳定(MSS)患者(MSS组,n=13221)的临床及分子特征。结果MSI在结直肠癌中的发生率为7.15%,且MSI检出率在诊断年龄、肿瘤位置、样本类型等方面均存在差异。MSI-H组TMB显著高于MSS组(92.8突变/Mb vs 12.7突变/Mb,P<0.05)。结直肠癌患者EBV阳性率为0.43%(27例),而MSI-H未检测到有EBV阳性的患者。ERBB 2、PIK3CA和BRAF等在MSI-H组中的频率都明显更高,但APC(51.26%vs 70.76%,χ^(2)=168.823,P<0.01)、TP53(27.76%vs 69.54%,χ^(2)=739.882,P<0.01)、NRAS(1.86%vs 3.98%,χ^(2)=11.445,P<0.01)在MSS组中的阳性率更高。此外,携带一个DNA错配修复基因(MMR)变异的患者在MSI-H型中占比更高(P<0.05)。结论四川地区结直肠癌MSI-H型与MSS型具有不同的分子特征,且在TMB及EBV感染也有所差异。